Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GEN1Q17RS7 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GEN1Q17RS7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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