Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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FAM187BQ17R55 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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FAM187BQ17R55 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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FAM187BQ17R55 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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FAM187BQ17R55 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FAM187BQ17R55 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FAM187BQ17R55 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FAM187BQ17R55 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FAM187BQ17R55 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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FAM187BQ17R55 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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FAM187BQ17R55 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM187BQ17R55 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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