Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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SCN9AQ15858 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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SCN9AQ15858 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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SCN9AQ15858 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCN9AQ15858 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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