Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms