Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TAF13Q15543 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms