Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCOLCEQ15113 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms