Protein–RNA interactions for Protein: Q14432

PDE3A, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase A, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3AQ14432 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDE3AQ14432 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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