Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SPIDRQ14159 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms