Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKP1Q13835 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PKP1Q13835 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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