Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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