Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CDH18Q13634 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CDH18Q13634 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CDH18Q13634 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CDH18Q13634 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CDH18Q13634 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CDH18Q13634 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH18Q13634 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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