Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM28Q13263 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIM28Q13263 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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