Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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FOXF1Q12946 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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FOXF1Q12946 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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FOXF1Q12946 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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FOXF1Q12946 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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FOXF1Q12946 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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FOXF1Q12946 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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FOXF1Q12946 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
FOXF1Q12946 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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