Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
FAM27E3Q08E93 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms