Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PPP3CAQ08209 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms