Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EGR3Q06889 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms