Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms