Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms