Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CENPEQ02224 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms