Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms