Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN10P78369 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms