Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms