Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RAD23AP54725 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms