Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CACNA2D1P54289 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms