Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TAF6P49848 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF6P49848 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF6P49848 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF6P49848 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF6P49848 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF6P49848 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF6P49848 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF6P49848 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF6P49848 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF6P49848 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TAF6P49848 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms