Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMD8P48556 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMD8P48556 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms