Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SFNP31947 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SFNP31947 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFNP31947 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms