Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MARCKSP29966 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms