Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARID4AP29374 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms