Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PLNP26678 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PLNP26678 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms