Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRKCHP24723 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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