Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms