Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XBP1P17861 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XBP1P17861 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
XBP1P17861 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms