Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms