Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GP1BBP13224 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms