Protein–RNA interactions for Protein: P0CG37

CFC1, Cryptic protein, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1P0CG37 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CFC1P0CG37 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms