Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXD4P09016 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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