Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PF4P02776 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PF4P02776 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PF4P02776 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PF4P02776 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PF4P02776 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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