Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5O95196 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CSPG5O95196 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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CSPG5O95196 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CSPG5O95196 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CSPG5O95196 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CSPG5O95196 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CSPG5O95196 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CSPG5O95196 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CSPG5O95196 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CSPG5O95196 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSPG5O95196 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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