Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PPFIA3O75145 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms