Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MSCO60682 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MSCO60682 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MSCO60682 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSCO60682 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSCO60682 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSCO60682 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSCO60682 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSCO60682 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSCO60682 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSCO60682 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSCO60682 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSCO60682 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSCO60682 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MSCO60682 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms