Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AGAP6-203ENST00000618025 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 LINC01159-201ENST00000433433 3103 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 RAB7B-201ENST00000617070 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 CLPB-201ENST00000294053 3240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 TK2-206ENST00000527800 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 DENND2A-210ENST00000537639 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 C17orf80-201ENST00000255557 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 DCT-202ENST00000446125 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PPARD-204ENST00000418635 3453 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 NT5C3AP1-202ENST00000441170 1663 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 CNOT4-203ENST00000361528 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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