Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SOBPA7XYQ1 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SOBPA7XYQ1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SOBPA7XYQ1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SOBPA7XYQ1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SOBPA7XYQ1 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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