Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KNCNA6PVL3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms