Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC169A6NNP5 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms