Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms