Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRPRBQ9Y5M8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms