Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BRPF3Q9ULD4 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BRPF3Q9ULD4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms