Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms