Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms